Nhưng phải thừa nhận, trong sự phát triển quan hệ Trung-Mỹ, vẫn tồn tại sự bất đồng. Vì vậy, thứ trưởng ngoại giao TQ Dương Khiết Trì cho rằng, những bất đồng này là nhân tố ảnh hưởng đến sự phát triển quan hệ Trung-Mỹ, để thu hẹp sự bất đồng, hai bên Trung-Mỹ cần phải tăng cường hiểu biết, tìm cái giống nhau, gác lại sự bất đồng. Ông lấy ví dụ nói: " Vấn đề Đài Loan liên quan tới chủ quyền và tròn vẹn lãnh thổ TQ, vấn đề Đài Loan giải quyết tốt, quan hệ Trung-Mỹ sẽ phát triển ổn định.

 Trong quá trình phát triển nhanh chóng quan hệ thương mại Trung-Mỹ, mâu thuẫn thương mại giữa hai nước có sự tăng lên, xử lý ổn thoả các vấn đề liên quan có ý nghĩa quan trọng đối với việc giữ gìn và thúc đẩy quan hệ thương mại hai nước phát triển bình ổn. Đối với vấn đề nhân quyền, tôn giáo, hai bên hai bên cần phải tiếp tục triển khai đối thoại trên cơ sở bình đẳng tôn trọng lẫn nhau, tăng cường hiểu biết, thu hẹp bất đồng."

Phó tổng tham mưu trưởng quân giải phóng nhân dân TQ Hùng Quang Khải cho rằng, làm thế nào quán triệt nhận thức chung mà nhà lãnh đạo Trung-Mỹ đã hoặc sắp đi đến nhất trí, ứng đối tốt hơn sự thách thức trong thời kỳ mới là then chốt của quan hệ Trung-Mỹ.